1 E. Domínguez, L. España, G. López-Casado, J. Cuartero and A. Heredia, Funct. Plant Biol., 2009, 36, 613–620.
2 H. A. Stafford, Plant Physiol., 1991, 96, 680–685.
3 C. H. Shih, H. Chu, L. K. Tang, W. Sakamoto, M. Maekawa, I. K. Chu, M. Wang and C. Lo, Planta, 2008, 228, 1043–1054.
4 K. S. Gould, J. Biomed. Biotechnol., 2004, 2004, 314–320.
5 R. V. Phadke, A. Bhattacharyya, A. Handique, K. Jain, A. Kumar, V. Singh, D. Baruah, T. Kumar, S. Patwari and B. M. Mohan, Interv. Neuroradiol., 2014, 20, 357–367.
6 G. L. Wang, Z. Wei, S. X. He, X. J. Zhou and Z. S. Liang, Zhiwu Ziyuan Yu Huanjing Xuebao, 2011, 20, 1–8.
7 Y. Yuan, Y. Liu, C. Wu, S. Chen, Z. Wang, Z. Yang, S. Qin and L. Huang, PLoS One, 2012, 7, e42946.
8 J. L. Ferrer, J. M. Jez, M. E. Bowman, R. A. Dixon and J. P. Noel, Nat. Struct. Biol., 1999, 6, 775–784.
9 D. Y. Suh, K. Fukuma, J. Kagami, Y. Yamazaki, M. Shibuya, Y. Ebizuka and U. Sankawa, Biochem. J., 2000, 350, 229–235.
10 J. M. Jez and J. P. Noel, J. Biol. Chem., 2000, 275, 39640–39646.
11 X. J. Liu, Y. N. Chuang, C. Y. Chiou, D. C. Chin, F. Q. Shen and K. W. Yeh, Planta, 2012, 236, 401–409.
12 B. Zhou, Y. Wang, Y. Zhan, Y. Li and S. Kawabata, Am. J. Bot., 2013, 100, 2458–2467.
13 L. Chen, H. Guo, Y. Lin and H. Cheng, Plant Cell Rep., 2015, 34, 885–894.
14 Y. Mo, C. Nagel and L. P. Taylor, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 1992, 89, 7213–7217.
15 R. B. Horsch, J. E. Fry, N. L. Hoffmann, D. Eichholtz, S. G. Rogers and R. T. Fraley, Science, 1985, 227, 1229–1231.
16 K. Singh, J. Raizada, P. Bhardwaj, S. Ghawana, A. Rani, H. Singh, K. Kaul and S. Kumar, Anal. Biochem., 2004, 335, 330–333.
17 X. Liu, S. Liu, J. Wu, B. Zhang, X. Li, Y. Yan and L. Li, Plant Physiol. Biochem., 2013, 70, 354–359.
18 M. Jiang and J. Zhang, Plant Cell Physiol., 2001, 42, 1265–1273.
19 K. V. Madhava Rao and T. V. S. Sresty, Plant Sci., 2000, 157, 113–128.
20 J. Y. Qian, D. Liu and A. G. Huang, Food Chem., 2004, 87, 283–288.
21 N. Sierro, J. N. D. Battey, S. Ouadi, N. Bakaher, L. Bovet, A. Willig, S. Goepfert, M. C. Peitsch and N. V. Ivanov, Nat. Commun., 2014, 5, 3833.
22 S. Xu, T. Brockmöller, A. Navarro-Quezada, H. Kuhl, K. Gase, Z. Ling, W. Zhou, C. Kreitzer, M. Stanke, H. Tang, E. Lyons, P. Pandey, S. P. Pandey, B. Timmermann, E. Gaquerel and I. T. Baldwin, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2017, 114, 6133–6138.
23 The Tomato Genome Consortium, Nature, 2012, 485, 635–641.
24 H. T. M. Tran, T. Ramaraj, A. Furtado, L. S. Lee and R. J. Henry, Plant Biotechnol. J., 2018, 16, 1756–1766.
25 The Arabidopsis Genome Initiative, Nature, 2000, 408, 796–815.
26 A. Bateman, L. Coin, R. Durbin, R. D. Finn, V. Hollich, S. Griffiths-Jones, A. Khanna, M. Marshall, S. Moxon, E. L. L. Sonnhammer, D. J. Studholme, C. Yeats and S. R. Eddy, Nucleic Acids Res., 2004, 32, D138–D141.
27 C. B. Do, M. S. P. Mahabhashyam, M. Brudno and S. Batzoglou, Genome Res., 2005, 15, 330–340.
28 S. Guindon, F. Delsuc, J. F. Dufayard and O. Gascuel, in Bioinformatics for DNA Sequence Analysis, ed. D. Posada, Humana Press, Totowa, NJ, 2009, pp. 113–137.
29 I. Abe and H. Morita, Nat. Prod. Rep., 2010, 27, 809–838.
30 S. S. Kim, E. Grienenberger, B. Lallemand, C. C. Colpitts, S. Y. Kim, C. d. A. Souza, P. Geoffroy, D. Heintz, D. Krahn, M. Kaiser, E. Kombrink, T. Heitz, D.-Y. Suh, M. Legrand and C. J. Douglas, Plant Cell, 2010, 22, 4045–4066.
31 K. Abdel-Lateif, V. Vaissayre, H. Gherbi, C. Verries, E. Meudec, F. Perrine-Walker, V. Cheynier, S. Svistoonoff, C. Franche, D. Bogusz and V. Hocher, New Phytol., 2013, 199, 1012–1021.
32 A. P. Wasson, F. I. Pellerone and U. Mathesius, Plant Cell, 2006, 18, 1617–1629.
33 Z. Chen, J. Tan, G. Yang, M. Miao, Y. Chen and T. Li, Phytochem. Lett., 2012, 5, 233–235.
34 J. Chen, H. Leng, Y. Duan, W. Zhao, G. Yang, Y. Guo, Y. Chen and Q. Hu, Phytochem. Lett., 2013, 6, 144–147.
35 R. Mittler, S. Vanderauwera, M. Gollery and F. Van Breusegem, Trends Plant Sci., 2004, 9, 490–498.
36 C. Rice-Evans, N. Miller and G. Paganga, Trends Plant Sci., 1997, 2, 152–159.
37 M. Melidou, K. Riganakos and D. Galaris, Free Radic. Biol. Med., 2005, 39, 1591–1600.
38 G. Agati and M. Tattini, New Phytol., 2010, 186, 786–793.
39 L. Jaakola and A. Hohtola, Plant Cell Environ., 2010, 33, 1239–1247.
40 R. S. Dhindsa and W. Matowe, J. Exp. Bot., 1981, 32, 79–91.